莫德尔陆军元帅指挥着两个集团军群。他不愿坐等那些希特勒已答应调给他的师到达，便将北乌克兰集团军群的几个装甲师逐步调到了中央集团军群。当北乌克兰集团军群本身在几个星期以后遭到敌人猛攻时，人们才感到调走这支预备队是多么可惜。到月底，莫德尔才发现苏军要夺取的目标比当时所想象的要深远得多，它要夺取的是莫洛迭奇诺和巴腊诺维契附近穿过纳利博卡森林沼泽地的陆桥。这些陆桥通有公路和铁路。要坚守希特勒的波洛次克-列彼耳-别烈律纳河-斯卢次克防线，这个方针是从不动摇的。7月2日，莫德尔不得不承认他连守明斯克或援救第4和第9两个集团军的许多被围部队都无能为力了。他报告陆军总部，说他需要有更多的部队才能阻挡莫洛迭奇诺和巴腊诺维契以西的敌军。维尔纽斯城本身看来也要受到威胁，莫德尔便联合蔡茨勒提请元首把北方集团军群撤到里加以西。
德军把拼凑起来的少量预备队投入战斗后，也未能挡住苏军的进攻。第14和第95两个步兵师以及第60装甲护卫师被投入战斗。第20装甲师由于未能扭转局势，师长被立即撤职。摩托化部队因燃料奇缺无法沿道路实施远距离机动，而且铁路交通也因苏联空军和游击队的轰炸和破坏不仅速度慢而且很危险。大片的森林沼泽地成了非正规军和盗匪的出没之处。由于德军的运动离不开道路，主要的公路都受到游击队的骚扰。蒂佩尔斯基希的德军第4集团军所属的三个军在正面遭到第2白俄罗斯方面军进攻时一方面向西撤退，另一方面还得设法保障其翼侧和保持其后方交通线畅通。望不到头的重炮、高炮、摩托车辆和马匹的行军队伍沿着婉蜒的公路朝着别烈津纳河大桥缓缓蠕动。看不到几架德国飞机，而苏联空军连续不断的轰炸造成了大量的伤亡(其中有三个将军被炸死)，而且还炸断了别烈津纳河大桥。在德军工兵抢修大桥时，大队人马和运输车辆聚集在桥东，结果遭到苏联空军猛烈的轰炸和扫射。
7月1日，罗特米斯特罗夫的第5近卫坦克集团军渡过别烈律纳河到达鲍里索夫以北的地区。三天以后，它协同第11近卫集团军和第31集团军攻克了白俄罗斯加盟共和国首都明斯克。德军第4集团军的大部和第9集团军的一部，据称共计十万人，被围在明斯克以东一个大口袋内。7月5日到11日，苏军最高统帅部着手歼灭这些德军，这并没有影响其坦克部队迅速向西运动。德军第4集团军被包围在沃尔马河与别烈津纳河之间，这些被围的德军被分割成两大部分，一部分由第78突击师师长特劳特指挥，另一部分由第12军军长米勒指挥。1941年在白俄罗斯也出现过类似的局面，这次只是包围者与被包围者对调了位置。据朱可夫说，大量敌军被歼，因为火炮和“卡秋莎”火箭炮加上成批的轰炸机都对被围之敌进行了猛烈轰击。被围的德军中大部分能逃的都逃了，逃不成的均被炸死。有的是单独逃跑的，有的是小股逃窜的，总之，抵抗的时间并不长。7月8日，米勒率部投降。九天之后，这五万七千名俘虏被押解着走过莫斯科街头。第9集团军的一部顺利地向西逃到了巴腊诺维契，这应归功于一路奋战到东部接应他们的一个装甲师。整个中央集团军群只剩下两翼。第2集团军仍在南翼的普里皮亚特沼泽地，第3装甲集团军则在北翼。中央集团军群所属的大约二十八个师已经溃不成军，伤亡总数高达三十万人。德军防线被撕开了一个宽达二百五十英里的大缺口。这样一来，通往波罗的海各国和东普鲁士的道路似乎敞开了，因此东普鲁士的边防部队和训练团，甚至元首自己的警卫营，都奉命奔赴东部战场以堵塞缺口。德军这次惨败不亚于斯大林格勒之战。
苏军最高统帅部决定利用这个局面，不等德军堵住缺口就将白俄罗斯残敌肃清，尔后进驻波罗的海各国以及波兰。右翼巴格拉米扬的第1波罗的海方面军将向道加夫皮耳斯和维尔纽斯以北地区进攻；切尔尼亚霍夫斯基的第3白俄罗斯方面军则负责占领维尔纽斯及其以南地区。南部左翼的扎哈罗夫的第2白俄罗斯方面军负责进攻布勒斯特。这一系列新的进攻进展迅速，第1波罗的海方面军轻而易举地夺取了道加夫皮耳斯至维尔纽斯的铁路线，虽然后来德军的抵抗越来越猛烈。道加夫皮耳斯至考纳斯的公路被切断，但是奇斯佳科夫的第6近卫集团军却没能攻克道加夫皮耳斯城。第3白俄罗斯方向军向维尔纽斯实施进攻。德第3装甲集团军在这里已将其所属兵员和一些掉队的官兵织成一支部队。罗特米斯特罗夫的第5近卫坦克集团军和克雷洛夫的第5集团军于7月13日占领该城，并抗击了德军的多次反突击。尔后罗特米斯特罗夫的坦克部队实施突击，迫使第3装甲集团军残部撤退到西北方向的立陶宛境内。在中央集团军群与北方集团军群之间使出现了一个大缺口。往南，扎哈罗夫的第2白俄罗斯方面军十天内推进了一百六十英里(在格罗德诺以南渡过涅曼河)，距东普鲁士边界已不到五十英里。同时，罗科索夫斯基的第1白俄罗斯方面军在五百架轰炸机的支援下，十二天内前进了一百余英里，占领了巴腊诺维契，并在向布勒斯特进军时从翼侧包围了品斯克。
7月9日，到中央集团军群上任只经历了十二个折磨人的日日夜夜的莫德尔，同仅担任北方集团军群司令五天的弗里斯纳一起坐飞机去请求独裁者放弃爱沙尼亚，增派部队去堵塞那么多的缺口。他俩的请求再次被拒绝，其原因之一，是这样做会对芬兰军队有影响，原因之二，是德国海军反对。7月12日，弗里斯纳以个人名义给元首写了一封信，指明局势的严重性，而希特勒却将这封信视为一种要挟，拒不接受。在尔后的几天内，莫德尔和弗里斯纳指挥的两个集团军群情况继续恶化。7月10日，叶廖缅科的第2波罗的海方面军进攻了汉森的第16集团军，尔后直捣烈捷克涅。一周以后，北部的马斯连尼科夫的第3波罗的海方面军在贝帕斯湖以南开始进攻。在纳尔瓦河畔，戈沃罗夫的列宁格勒方面军天天都有可能发动新的攻势。7月15日，来自克里木的钦奇巴兹的第2近卫集团军和克列泽尔的第51集团军调离最高统帅部预备队，加入了巴格拉米扬的第1波罗的海方面军。几天之后，这两个集团军转入进攻，向西北经立陶宛入拉脱维亚突入中央集团军群和北方集团军群之间的缺口。7月18日，莫德尔和弗里斯纳再度晋见元首，莫德尔请求派兵堵塞立陶宛的缺口，由于他本人兵力有限，他建议从北方集团军群抽调必要的兵力，这使弗里斯纳大为不满。弗里斯纳也有自己的难处。如果苏军冲到里加湾，北方集团军群就会被切断与中央集团军群的联系从而被围。如果南部战线延长，苏联在东部压力再加大，为了不致被赶进波罗的海，他连一兵一卒也不能放。弗里斯纳全力以赴满腔热忱地接管了这个集团军群之后，便决心遵照希特勒的指示，在他的东南方向发动一次快速反突击以支援中央集团军群，但是几天的实战情况使他认识到他的前任林德曼的见解是正确的。弗里斯纳同样也要求元首准许他有机断行事的自由，否则他就要求解除他的职务。
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