太平天国后期事权不一，制度纷更，军队编制变化频繁，诸王所部又极不统一。因此有必要对不同的部队分别加以考察。
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我们先来考察一下童容海的东方扶朝天军。这支部队曾随翼王石达开远征广西。《清册》载有东王杨秀清衔发的“后八军前营师帅”官执照，这是1856年天京事变前的太平军番号。石达开改变了太平天国的军制和官制。彭大顺被封为“翼殿右一旗大军略”。1860年，这支部队在彭大顺、童容海等率领下，脱离了石达开，“万里回朝”，原来的“翼殿侯、相、检点、指挥，均照陛下制度给印”(见《吉庆元朱衣点等六十七将领缕陈军情请准暂居原职共图报效本章》。)，恢复了旧制。《清册》中有“天官燕提掌军民加弍秩彭大顺”衔发的“中一军军帅”、“中一军内医”等官执照和无姓名的天侯印6颗、丞相印11颗、检点印13颗。虽然仍用“加秩”而不复“加等”，残留了一点殿官制的痕迹，但“中一军”的番号和这些官名爵称都符合天朝的统一制度(“天官燕”犹如后来的“天官义”，是一种特衔，职司吏部天官事务。)，惟这些官印的尺寸略大于前期规定。
1861年9月，这支队伍在江西铅山归隶忠王李秀成。童容海封为殿左东破忾军主将观天义，旋改“扶朝天军左东主将”1862年初晋封保王，统辖东方扶朝天军。从《清册》的一些官照看来，这支部队“回朝”之初，保持了军营编制，仍以军为单位。军的番号有“中军”、“后军”“前二军”、“后一军”、“后二军”、“左一军”、“左二军”、“右二军”、“中三军”等。大概初分前、后、左、右、中5军，后以前，后、左、右、中与数字一至三编次，均冠“殿前”二字。每军分前、后、左、有、中5营。但军中官已和前期全然不同。官照中尚有大量的丞相，少数的检点和个别的指挥，如“后一军前营右十丞相”、“后二军前营左九检点”、“前二军后营左十五指挥”之类。丞相、检点、指挥为营以下的军官。其系衔，丞相、检点均从左一到右十，各10名。指挥仅见上举一例，亦以左右与数字编排，至少有16名，但以官级太低，旋即废而不置。军、营两级的军官，当以豫、侯担任。以前一军为例，列其编制系统简表：(附图)拿它跟前期军营编制比较一下，豫、侯、丞相，检点和指挥，其职位分别相当于前期的军帅，师帅、旅帅。卒长和两司马，而官级却一律提升了8级。
军以上，以队统之。《清册》中有“本第前队检点”，“本第后队检点”，“本第中队前巡查”。“本第中队内医义天预”等官照，当是童容海由观天燕到主将观天义这段时间颁发的。从“中队前”之称，可知中队还分前、后、左、右、中。1862年晋封保王后，由“第”升“府”、称“殿”，有保府大后队哨务”，“保殿大前队巡查”等官照。刘三佑由“本第中队前巡查升博天燕任保殿中队前巡查”。原来的丞相、检点、指挥等，都迅速、频繁以至越级升官晋爵，有的改任典官或属官。如谭初伏由殿前左二军后营右二丞相升本第后队正典旗升伏天预又升燕，刘孔时主殿前后二军后［营右］二检点升本第后队正典木升望天预又升燕，刘坤珊由殿前前二军后营左十五指挥升秉天侯，唐明发由前后一军前营右六丞相升天侯副军政司。各队统领分别升为天将、朝将和主将。如熊正王由本第中队检点升天安统领保殿中队升殿前东方天军精忠天将，黄有虎由本第右队检点升童主将队内黄天豫改勋臣黄天豫升黄天福升天安统领保府大右队升前东方天军威武朝将，朱大椒由恩检点升茎天福升茎天安统领保府右队升殿前东方扶朝天军破忾主将茎天义。各级典官和属官大都升封六爵。原先的军营编制维持不下去了，东方扶朝天军遂改做以队为单位的编制。
3
以队为单位的编制，在太平天国后期是相当普遍的。罗老文章繁征博引，作了精辟的论述(罗尔纲《太平军每军实数及后期编制考》，《文史》1984年总21期第155～163页。)。
这种编制，大致可以分为两类情况。
一类队下有营，也可以叫做队营编制。《清册》载有“忠府大中队前二营炎一巡查”官印，《名册》中有《护殿前一队理天义右营天安天安属下年名菁（清）册》，都是实例。
有的队下再分前、后、左、右、中，未赘“营”字，实际上也是队营编制。比较典型的要算英王陈玉成的部队。
早在1358年初，成天福陈玉成的部将鉴天豫涂连炤，就曾整顿队伍军规，派分队伍，“吁天侯卜弟分为前队，羡天侯倪弟分为后队，但弟（指殿前右六十二丞相曾某）统带之官兵分为右队，如兄与丞相蒙弟共为中队。”(《鉴天豫涂命殿前右六十二丞相曾在本队宣讲道理照会》，《太平天国文书汇编》第181页。)
1861年4月，曾国藩在日记中说，“伪英王统下有五大队、五小队。五大队，前大队则天义梁成富，左大队吁天安卜占魁，右大队量天安唐正才，中大队格天义陈时永，后大队已散。五小队，前队裁天福黄，左队监安天马，右队浩天安刘玱林（即精忠主将），中队涵天安罗正举，后小队已散。”(罗尔纲《太平军每军实数及后期编制考》，《文史》1984年总21期第155～163页。)
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